嘉義往返澎湖的船班目前以聯營船班與雲豹輪為主，前去澎湖皆為上午航班訂船票用哪個app，前往布袋皆為下戰書航班。由於船公司逐日派班狀況分歧與停靠碼頭客輪調度等要素，即便為表訂的「預定船班表」逐日固定船班澎湖船班時刻，也會機動調整開船時間，實際船班時間仍以船公司放置為主。已於飛魚網預訂澎湖船票的搭客，將會收到Email通知確認船班；詳細澎湖船班資訊可見即時船班時刻表。
澎湖航線因淡旺季及碼頭停靠調度等要素， 船班確認開航時間以下訂後回答為主，開航時間如有變更飛魚網將提前通知。
本時刻表為飛魚網代訂船票結果之匯總（每五分鐘同步更新），實際船班時刻仍以船公司公佈為準〔 ○ 接管預訂 ● 客滿 / x 船班打消〕
聯營航班由滿天星、太吉之星表_澎湖搭船、凱旋三間船公司配合供給運務，選擇聯營航班的搭客依現場聯營放置搭搭客輪。後壁湖蘭嶼船票-富岡蘭嶼船票
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