高雄港所正在地明朝後期原為漁村，荷蘭與鄭順利據臺時期都有開拓，清初已成為高屏地區商品集散中樞，原稱打狗港。清鹹豐年間（1858年）按照中英條約，高雄港開口互市，1863年建立海關高雄關。光緒年間，清廷正在此築築火等陣地，英法領事與洋商時來勘查。
高雄港的碼頭按照與特征，能夠分為蓬萊商港區、鹽埕商港區、苓雅商港區、中島商港區、前鎮商港區、小港商港區、中興商港區與大仁商港區灣。還有一些零散分佈的小漁港、造船廠與修船場等等。
高雄港現有營運碼頭約116座，此中雜貨碼頭30座、貨櫃碼頭24座、散裝碼頭32座、榖類碼頭2座。別的客輪、軍艦、港務、事情碼頭共28座。還有倉庫96座，容量57.6萬噸。貨櫃場5處，供貨櫃轉運。港區現有貨櫃裝卸橋（橋式機）及裝卸搬運機械170架。
高雄港所正在灣區是一狹長海灣，原為一舄湖，總長度12公裏高雄港口的英文，寬度約為1公裏至1.5公裏。入口寬度則只要100公尺，形狀類似口。水域面積1,276公頃，有兩個入海通道，進出港航道長18公裏，港區海域設有兩套防波堤。目前高雄港航道戰港區水域水深自11.3到16.0公尺不等，可供15萬噸級海輪進出港戰停靠。港區水域錨地2處，設浮筒泊位24組，可泊萬噸級以上船24艘，超級油輪浮筒2座，分別可泊15萬噸級戰25萬噸級巨型油輪。錨泊地總泊數可達190多艘。
2004年高雄港進出港船次約為39,000艘次，為歷年最岑嶺。2005年為38,000艘次。
1959年後，高雄港展開十二年擴築計劃等多項辦法，至1980年已有深水碼頭27座，淺水碼頭2座。附設高雄加工出口區、前鎮漁港、臨海工業區、一貫作業大煉鋼廠、造船廠（臺灣中船），以中舉一、二、三、四貨櫃核心等。至2000年，高雄港再度築成5個貨櫃核心，8個新築深水碼頭，營運貨櫃威力達到1,000萬標準箱（TEU）。
高雄港曾長期位居世界海洋貨運第三大港，僅次於與新加坡。貨櫃進出口于2004年達到歷史紀錄940萬TEU。近來由於遭到區域內其他口岸，包羅傳統大港、釜山以及新興口岸鹽田、洋山、浙江寧波、山東之競爭挑戰，高雄港吞吐略有下滑，2005年吞吐貨櫃為947萬TEU，是環球前二十大港中，獨一吞吐闌珊者。目前高雄港貨運吞吐量佔全島三分之二。
正在清代，打狗港原是南部僅次於安平港的第二大港，但由於後來安平口岸岸淤積嚴重，使得當時的洋船都難以進入，打狗港於是與而代之。且由於此時打狗港右近的要地當地逐漸開發，加以物價低廉，因而逐漸吸引外商前來採購平易近生物品以及投資。從此打狗港便成為英、美商人爭逐的焦點，但其後由於美商經營不善，因而打狗港逐漸成為英商的地盤。且隨著對外貿易的逐漸發展，打狗港右近産生許多新的聚落，高雄市目前許多地名如旗後莊、鹽埕埔莊、哨船頭、苓仔寮、三塊厝等地即是此時開始發跡。
1895年根據馬關條約臺灣割讓，“臺灣國”建立併發起戰事抵當，日軍于1896年9月方佔領港區。為強化本港貨運功效，于1900年後展開多次計劃拓築，1912歲首年月步築成七座碼頭，可泊3,000噸船隻。1937年完成二度改築，可停8,000噸船隻，碼頭擴至16座，倉庫19座。10,000噸船隻也可進出港區。航線方面，1924年已有高雄-橫濱線、高雄-廣東線、高雄-線、臺灣-朝鮮 / 滿州國線等網台，貿易總額當年吞吐量達158萬噸。1939年吞吐量又巨升至320萬噸，達到日據高雄的最岑嶺。
1944年中期以後，盟軍正在承平洋戰場展開，美軍已漸次贏得新幾內亞、島、菲律賓等戰場勝利，已能對臺灣、琉球間接空襲。10月以後，高雄港受到盟軍狠惡轟炸，所有碼頭倉庫幾盡摧毀。日軍為避免美軍登陸作戰時本港補給物資，自重大船五艘封鎖港道，高雄港幾乎成為死港。
1945年戰敗，國平易近黨來臺領受後，于10月正式建立高雄港務局主管高雄港業務，打撈重船以清算航道，至1955年始恢復一般營運。
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